两年前的时候写过一个关于Mrbayes MPI版的编译与应用的笔记（传送门）。其实我不是主做系统发育的，这个软件给别人跑的是最多的，给自己几乎没用过。这两天捡起来的时候发现，有些内容已经变了，就当是做个更新吧。
如果是用Ubuntu的童鞋就有福气了，其实Ubuntu的新立德软件管理器里是包含了Mrbayes的安装源的，而且还有MPI版，一个命名为mb，一个是mb-mpi。所以，已经不需要自己再编译了，即使需要自己编译，两年前笔记中的方法也没有过时。我的服务器是不带GPU的，自己编译的时候看自己需要。
这次更新主要是针对MPI框架运行的一个更新。在Ubuntu 18.04 LTS中，目前，openMPI和MPICH，貌似已经整合了，尽管软件安装是分开的，但是运行被统一在了mpiexec下，除了mpiexec外，还有mpiexec.openmpi、mpiexec.mpich和mpiexec.hydra。但我使用mpiexec.openmpi运行mb-mpi是存在问题的，具体原因没有调查。不知道是少安了运行库还是怎么样，但mpiexec.mpich是pass的。所以，也没有深究。运行命令没什么变化，就是参照如下。
mpiexec.mpich -n 8 mb ./seq2.nex &
这篇够水的，就这样吧。[捂脸]